Em um esforço para reduzir a probabilidade de crimes sexuais no Japão, uma prestigiada escola só para homens alivia seus alunos usando o serviço de jovens garotas. As razões pelas quais essas meninas são lançadas nessa carreira incomum são muitas, desde dívidas até punições por crimes. Tratadas como nada mais do que mercadorias patrocinadas pelo governo, elas são despidas de suas roupas e identificadas apenas pelo número que lhes foi atribuído.
Nakagawa raramente presta muita atenção em alguém na escola, mas isso muda quando ele começa um relacionamento com a garota conhecida como "Número 3". Como as interações pessoais entre os alunos e as meninas são proibidas, os dois decidem usar o telhado da escola como local de encontro particular. Passando os dias juntos em segredo, Nakagawa começa a aprender mais sobre a "Número 3" e sobre a verdade obscura por trás do controverso programa.
